Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms