Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MALSU1Q96EH3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms