Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUNDC1Q96C34 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms