Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms