Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.314e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 FYN-221ENST00000520518 864 ntTSL 516.97■□□□□ 0.314e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.34e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.34e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CNPY2-208ENST00000551286 484 ntTSL 516.89■□□□□ 0.294e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 PANK4-202ENST00000435556 2524 ntTSL 216.86■□□□□ 0.293e-11■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.294e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 WDR62-205ENST00000587391 5971 ntTSL 1 (best)16.82■□□□□ 0.284e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.284e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 ASPSCR1-209ENST00000581484 1001 ntTSL 216.7■□□□□ 0.264e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 PANK4-203ENST00000468002 670 ntTSL 516.63■□□□□ 0.253e-11■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.254e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 RALB-206ENST00000449649 667 ntTSL 516.6■□□□□ 0.254e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.6■□□□□ 0.254e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.243e-11■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.224e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CXXC5-205ENST00000503511 506 ntTSL 216.37■□□□□ 0.214e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CXXC5-214ENST00000512816 558 ntTSL 316.37■□□□□ 0.214e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CXXC5-210ENST00000509238 542 ntTSL 216.37■□□□□ 0.214e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 PRKAR1B-205ENST00000414568 752 ntTSL 516.36■□□□□ 0.214e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.214e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 AC004223.3-202ENST00000591723 676 ntTSL 516.31■□□□□ 0.24e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.24e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.24e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 TPR-205ENST00000474852 2757 ntTSL 1 (best)16.26■□□□□ 0.194e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 VAV2-204ENST00000472905 506 ntTSL 316.25■□□□□ 0.194e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.194e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 RALB-202ENST00000412383 981 ntTSL 316.23■□□□□ 0.194e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.174e-7■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.164e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 ANKRD11-205ENST00000562194 618 ntTSL 316.01■□□□□ 0.154e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.154e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.144e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 ASPSCR1-207ENST00000579684 564 ntTSL 315.93■□□□□ 0.144e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CXXC5-212ENST00000511457 810 ntTSL 315.91■□□□□ 0.144e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CXXC5-202ENST00000502295 503 ntTSL 415.91■□□□□ 0.144e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CNST-204ENST00000483271 2767 ntTSL 215.88■□□□□ 0.134e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.134e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.124e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.124e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.124e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.124e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.124e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.114e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.14e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 KLHL26-204ENST00000596843 541 ntTSL 415.67■□□□□ 0.14e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.094e-7■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 ZCCHC14-202ENST00000561928 2548 ntTSL 515.61■□□□□ 0.094e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.074e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CXXC5-216ENST00000520967 878 ntTSL 315.45■□□□□ 0.064e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.064e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.064e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 PI4KB-205ENST00000430800 965 ntTSL 515.39■□□□□ 0.054e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.044e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 HMGA1-206ENST00000478214 716 ntTSL 1 (best)15.27■□□□□ 0.044e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CXXC5-204ENST00000502716 900 ntTSL 215.26■□□□□ 0.034e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 C10orf76-205ENST00000495001 2464 ntTSL 215.25■□□□□ 0.034e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 C12orf65-208ENST00000546132 573 ntTSL 415.24■□□□□ 0.034e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 MFSD12-210ENST00000589157 714 ntTSL 215.21■□□□□ 0.034e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.024e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.014e-7■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 AC004223.3-203ENST00000592181 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.11■□□□□ 0.014e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CNOT8-206ENST00000518775 920 ntTSL 515.1■□□□□ 0.014e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 SNED1-208ENST00000466618 2198 ntTSL 515.04■□□□□ -04e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 STK24-206ENST00000481288 656 ntTSL 315.01□□□□□ -0.014e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 ATAD3B-205ENST00000485748 3233 ntTSL 214.95□□□□□ -0.024e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.024e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.024e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.024e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.034e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 UROD-208ENST00000463092 968 ntTSL 214.81□□□□□ -0.044e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.044e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.054e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 RPA2-205ENST00000444045 682 ntTSL 514.74□□□□□ -0.054e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CASZ1-206ENST00000478728 648 ntTSL 514.7□□□□□ -0.064e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 USP7-208ENST00000563961 4533 ntTSL 514.69□□□□□ -0.064e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 SGSM2-213ENST00000574857 3885 ntTSL 214.68□□□□□ -0.064e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.064e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.074e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 PI4KB-211ENST00000489223 558 ntTSL 414.61□□□□□ -0.074e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 BRD2-213ENST00000495733 3404 ntTSL 214.6□□□□□ -0.074e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.084e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 SAMM50-203ENST00000474323 2368 ntTSL 214.54□□□□□ -0.084e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 BRD2-212ENST00000482914 4834 ntTSL 1 (best)14.47□□□□□ -0.094e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.14e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.14e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 ATAD3B-204ENST00000474481 3367 ntTSL 214.4□□□□□ -0.14e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 PI4KB-206ENST00000438243 1150 ntTSL 214.39□□□□□ -0.114e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.124e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.124e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.134e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.134e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.144e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 C12orf65-205ENST00000536130 604 ntTSL 314.12□□□□□ -0.154e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CXXC5-207ENST00000504944 568 ntTSL 314.12□□□□□ -0.154e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.164e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CNOT8-219ENST00000521729 1068 ntTSL 214.01□□□□□ -0.174e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CNOT8-222ENST00000522644 1027 ntTSL 513.98□□□□□ -0.174e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.179e-27■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 PTP4A2-209ENST00000526960 793 ntTSL 513.95□□□□□ -0.184e-6■■■■■ 48.1
Retrieved 100 of 20,769 protein–RNA pairs in 138.5 ms