Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms