Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZA2

RAPGEF4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF4Q8WZA2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF4Q8WZA2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAPGEF4Q8WZA2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAPGEF4Q8WZA2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAPGEF4Q8WZA2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAPGEF4Q8WZA2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAPGEF4Q8WZA2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAPGEF4Q8WZA2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF4Q8WZA2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF4Q8WZA2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF4Q8WZA2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF4Q8WZA2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF4Q8WZA2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF4Q8WZA2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF4Q8WZA2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF4Q8WZA2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF4Q8WZA2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF4Q8WZA2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF4Q8WZA2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF4Q8WZA2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF4Q8WZA2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF4Q8WZA2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF4Q8WZA2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF4Q8WZA2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF4Q8WZA2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF4Q8WZA2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF4Q8WZA2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF4Q8WZA2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF4Q8WZA2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF4Q8WZA2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF4Q8WZA2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF4Q8WZA2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF4Q8WZA2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
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