Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms