Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPAP2Q8IXW5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms