Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms