Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms