Protein–RNA interactions for Protein: Q6XXX2

LINC00114, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00114, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00114Q6XXX2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00114Q6XXX2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00114Q6XXX2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00114Q6XXX2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00114Q6XXX2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00114Q6XXX2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00114Q6XXX2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00114Q6XXX2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00114Q6XXX2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00114Q6XXX2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00114Q6XXX2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00114Q6XXX2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00114Q6XXX2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00114Q6XXX2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00114Q6XXX2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00114Q6XXX2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00114Q6XXX2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00114Q6XXX2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00114Q6XXX2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00114Q6XXX2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00114Q6XXX2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00114Q6XXX2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00114Q6XXX2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00114Q6XXX2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00114Q6XXX2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00114Q6XXX2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00114Q6XXX2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00114Q6XXX2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00114Q6XXX2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00114Q6XXX2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms