Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms