Protein–RNA interactions for Protein: Q6RI45

BRWD3, Bromodomain and WD repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRWD3Q6RI45 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRWD3Q6RI45 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRWD3Q6RI45 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRWD3Q6RI45 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRWD3Q6RI45 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRWD3Q6RI45 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRWD3Q6RI45 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRWD3Q6RI45 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRWD3Q6RI45 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BRWD3Q6RI45 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRWD3Q6RI45 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRWD3Q6RI45 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRWD3Q6RI45 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRWD3Q6RI45 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRWD3Q6RI45 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRWD3Q6RI45 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRWD3Q6RI45 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRWD3Q6RI45 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRWD3Q6RI45 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRWD3Q6RI45 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRWD3Q6RI45 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRWD3Q6RI45 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms