Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms