Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6P435 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6P435 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6P435 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6P435 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6P435 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6P435 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6P435 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6P435 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6P435 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6P435 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6P435 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6P435 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6P435 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6P435 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6P435 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6P435 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6P435 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6P435 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6P435 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6P435 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6P435 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q6P435 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Q6P435 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q6P435 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q6P435 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q6P435 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q6P435 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q6P435 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q6P435 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q6P435 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6P435 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6P435 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6P435 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6P435 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6P435 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6P435 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6P435 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6P435 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6P435 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6P435 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6P435 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6P435 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6P435 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6P435 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6P435 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6P435 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6P435 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6P435 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6P435 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6P435 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6P435 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6P435 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6P435 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6P435 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6P435 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6P435 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6P435 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6P435 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6P435 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6P435 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q6P435 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6P435 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q6P435 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q6P435 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6P435 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms