Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms