Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms