Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms