Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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FAM78BQ5VT40 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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FAM78BQ5VT40 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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