Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATAD3BQ5T9A4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATAD3BQ5T9A4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATAD3BQ5T9A4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATAD3BQ5T9A4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATAD3BQ5T9A4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATAD3BQ5T9A4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATAD3BQ5T9A4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATAD3BQ5T9A4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATAD3BQ5T9A4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATAD3BQ5T9A4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATAD3BQ5T9A4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATAD3BQ5T9A4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATAD3BQ5T9A4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATAD3BQ5T9A4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATAD3BQ5T9A4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATAD3BQ5T9A4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATAD3BQ5T9A4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATAD3BQ5T9A4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATAD3BQ5T9A4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATAD3BQ5T9A4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATAD3BQ5T9A4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATAD3BQ5T9A4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATAD3BQ5T9A4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATAD3BQ5T9A4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATAD3BQ5T9A4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATAD3BQ5T9A4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234.6 ms