Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC183Q5T5S1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms