Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GPAT3Q53EU6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GPAT3Q53EU6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GPAT3Q53EU6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GPAT3Q53EU6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GPAT3Q53EU6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPAT3Q53EU6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPAT3Q53EU6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPAT3Q53EU6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPAT3Q53EU6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPAT3Q53EU6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPAT3Q53EU6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPAT3Q53EU6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPAT3Q53EU6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPAT3Q53EU6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPAT3Q53EU6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPAT3Q53EU6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPAT3Q53EU6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPAT3Q53EU6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPAT3Q53EU6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPAT3Q53EU6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPAT3Q53EU6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPAT3Q53EU6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPAT3Q53EU6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms