Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms