Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLFNL1Q499Z3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms