Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

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Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP100Q494V2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
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