Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UVSSAQ2YD98 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms