Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms