Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MICAQ29983 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MICAQ29983 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MICAQ29983 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MICAQ29983 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MICAQ29983 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
MICAQ29983 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MICAQ29983 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MICAQ29983 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MICAQ29983 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MICAQ29983 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MICAQ29983 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MICAQ29983 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
MICAQ29983 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MICAQ29983 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MICAQ29983 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MICAQ29983 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MICAQ29983 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MICAQ29983 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MICAQ29983 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MICAQ29983 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MICAQ29983 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MICAQ29983 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MICAQ29983 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MICAQ29983 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MICAQ29983 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MICAQ29983 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MICAQ29983 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MICAQ29983 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MICAQ29983 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MICAQ29983 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MICAQ29983 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MICAQ29983 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MICAQ29983 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MICAQ29983 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MICAQ29983 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MICAQ29983 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MICAQ29983 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MICAQ29983 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MICAQ29983 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MICAQ29983 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MICAQ29983 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MICAQ29983 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MICAQ29983 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MICAQ29983 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MICAQ29983 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MICAQ29983 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MICAQ29983 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MICAQ29983 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MICAQ29983 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MICAQ29983 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MICAQ29983 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MICAQ29983 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MICAQ29983 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MICAQ29983 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MICAQ29983 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MICAQ29983 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MICAQ29983 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MICAQ29983 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MICAQ29983 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MICAQ29983 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MICAQ29983 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MICAQ29983 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MICAQ29983 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MICAQ29983 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MICAQ29983 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MICAQ29983 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MICAQ29983 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MICAQ29983 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MICAQ29983 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MICAQ29983 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MICAQ29983 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MICAQ29983 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MICAQ29983 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MICAQ29983 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MICAQ29983 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MICAQ29983 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MICAQ29983 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MICAQ29983 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MICAQ29983 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MICAQ29983 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MICAQ29983 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MICAQ29983 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MICAQ29983 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MICAQ29983 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MICAQ29983 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MICAQ29983 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MICAQ29983 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MICAQ29983 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MICAQ29983 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MICAQ29983 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MICAQ29983 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MICAQ29983 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MICAQ29983 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MICAQ29983 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MICAQ29983 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MICAQ29983 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MICAQ29983 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MICAQ29983 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MICAQ29983 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms