Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
DDR2Q16832 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR2Q16832 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms