Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPP1Q16831 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms