Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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PTPROQ16827 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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PTPROQ16827 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPROQ16827 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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