Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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