Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms