Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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