Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TLR1Q15399 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TLR1Q15399 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TLR1Q15399 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TLR1Q15399 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TLR1Q15399 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TLR1Q15399 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TLR1Q15399 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TLR1Q15399 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TLR1Q15399 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TLR1Q15399 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TLR1Q15399 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TLR1Q15399 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TLR1Q15399 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TLR1Q15399 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TLR1Q15399 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TLR1Q15399 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TLR1Q15399 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TLR1Q15399 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TLR1Q15399 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TLR1Q15399 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TLR1Q15399 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TLR1Q15399 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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