Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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EBI3Q14213 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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