Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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