Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms