Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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