Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IKZF1Q13422 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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