Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms