Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE3BQ13370 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
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