Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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ERCC8Q13216 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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ERCC8Q13216 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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ERCC8Q13216 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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ERCC8Q13216 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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ERCC8Q13216 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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ERCC8Q13216 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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ERCC8Q13216 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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