Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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