Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms