Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAF1AQ13111 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms