Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF1Q12946 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF1Q12946 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF1Q12946 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF1Q12946 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF1Q12946 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF1Q12946 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF1Q12946 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF1Q12946 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF1Q12946 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF1Q12946 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF1Q12946 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF1Q12946 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF1Q12946 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF1Q12946 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF1Q12946 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF1Q12946 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF1Q12946 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF1Q12946 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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