Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms