Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK18Q07002 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
CDK18Q07002 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK18Q07002 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK18Q07002 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK18Q07002 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK18Q07002 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK18Q07002 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK18Q07002 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK18Q07002 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK18Q07002 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK18Q07002 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK18Q07002 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK18Q07002 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms